El objetivo del curso es realizar un acercamiento a las metodologías genómicas para el estudio de la ecología microbiana. A cargo del Dr. Daniel Alejandro Medina Salas.
La Sección Carreras de Posgrado de la Secretaría de Docencia y Vida Estudiantil de la Sede Alto Valle - Valle Medio de la Universidad Nacional de Río Negro (UNRN), tiene el agrado de comunicar la apertura de inscripciones para el curso de posgrado Aproximaciones Bioinformáticas a la Ecología Microbiana. Iniciará el martes 24 y se extenderá hasta el viernes 27 de noviembre. Se cursará bajo la modalidad virtual y estará a cargo del Dr. Daniel Alejandro Medina Salas.
La ecología microbiana es la ciencia que estudia específicamente cómo interactúan los microorganismos con su entorno, tomando en cuenta tanto factores ambientales abióticos como bióticos. La revolución genómica en la microbiología ha sido un avance significativo en nuestra comprensión de los microorganismos y su funcionamiento. Gracias a los avances en la tecnología de la secuenciación de DNA es posible estudiar el genoma de diversos microorganismos, sin la necesidad de cultivarlos, a una escala masiva y a un costo cada vez menor. Esta revolución en la ecología microbiana ha permitido identificar y analizar todos los genes presentes en un nicho, a una resolución antes inalcanzable. Esto ha llevado a importantes avances en el campo de la taxonomía microbiana, ya que ahora es posible clasificar y diferenciar a los microorganismos en función de su información genética, así como también describir los elementos que estos poseen en su información genética.
Durante el último tiempo se ha utilizado el concepto conocido como microbioma para referirse a la comunidad de microorganismos, incluyendo bacterias, virus, hongos y arqueas, que coexisten en un ambiente específico, tales como el cuerpo humano, el suelo, el agua o el intestino de los animales. El gran desafío de estudiar el microbioma es la interpretación de la gran información que las herramientas genómicas nos entregan. Para ello, la bioinformática nos ofrece manejar, analizar y representar los resultados que se desprenden del so de las herramientas genómicas. El presente curso pretende entregar las bases necesarias para el uso de diversas herramientas que facilitan el trabajo e interpretación de resultados obtenidos del estudio del microbioma.
El curso tiene como objetivos lograr un acercamiento a las metodologías genómicas para el estudio de la ecología microbiana; realizar una introducción al estudio del microbioma y ecología microbiana; revisar las principales tecnologías que se utilizan para el estudio del microbioma y abordar los alcances de estas, entregar conocimientos sobre el uso de herramientas bioinformáticas para el análisis de datos obtenidos desde experimentos genómicos; explicar cómo se deben interpretar los resultados obtenidos del estudio del microbioma.
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Destinado a investigadores de diferentes campos interesados en aplicar herramientas bioinformáticas para el análisis microbiológico.
La carga horaria total es de 50 horas y está destinado a Investigadores de diferentes campos interesados en aplicar herramientas bioinformáticas para el análisis microbiológico.
Está a cargo del Dr. Daniel Alejandro Medina Salas, Ingeniero en Biotecnología Molecular chileno, Magister en Ciencias Biológicas; y Doctor en Biotecnología. Docente en la Universidad San Sebastián, Puerto Montt, Chile.
PROGRAMA
Martes 24 de noviembre
Ecología microbiana, microbioma y aproximaciones de secuenciación.
Introducción a ecología microbiana y estudio del microbioma; diversidad microbiana; secuenciación de amplicones y metagenómica de escopeta; principios de análisis taxonómico y funcional. Introducción práctica al análisis de datos de metagenómica shotgun mediante KBase, incluyendo manejo de archivos FASTQ y control de calidad.
Miércoles 25 de noviembre
Análisis bioinformático de datos de metagenómica de escopeta.
Clasificación taxonómica, bases de datos y k-mers; ensamblaje metagenómico y evaluación de su calidad. Actividades prácticas en KBase utilizando herramientas para clasificación taxonómica, ensamblaje mediante MEGAHIT/metaSPAdes y evaluación de ensamblajes con QUAST. Introducción a la recuperación de genomas ensamblados desde metagenomas (MAGs).
Jueves 26 de noviembre
Metagenómica funcional, MAGs y resistencia antimicrobiana.
Evaluación y clasificación taxonómica de MAGs mediante CheckM y GTDB-Tk, anotación funcional e interpretación del potencial metabólico de los microorganismos. Introducción al concepto de resistoma y actividad práctica mediante Galaxy y ABRicate, utilizando bases de datos especializadas como ResFinder y CARD.
Viernes 27 de noviembre
Evaluación final mediante análisis de artículos científicos.
Presentación y discusión crítica de artículos científicos relacionados con estudios del microbioma. Los estudiantes deberán identificar el objetivo y diseño del estudio, tipo de secuenciación, herramientas y bases de datos utilizadas, flujo bioinformático, resultados principales, limitaciones y conclusiones.
Las actividades de los días 24 al 26 de noviembre están contempladas como jornadas teórico-prácticas, desarrollando en cada caso primero los fundamentos conceptuales y posteriormente las actividades computacionales. El 27 de noviembre estará destinado principalmente a las evaluaciones y discusión de los artículos.
Por consultas comunicarse a carrerasdeposgradoavvm@unrn.edu.ar.
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APROBADO POR RESOLUCIÓN UNRN N° 1318/2026
